Dari pengalaman sejarah pendidikan dan Masa Kepemimpinan kepala sekolah, SMP Tanjung Harapan dan SMP Negeri 1 Komodo, dari masa ke masa, kepala sekolah yang telah menahkodai SMP Negeri 1 Komodo, antara lain. Kepala SMP Tanjung Harapan perdana, Bapak Raymundus Ratung( 1968-1975). Kepala SMP Tanjung Harapan kedua, Bapak Alexius Harum( 1976-1981). Kepala Sekolah ketiga, Bapak John Bey Gibbons, BA( 1981-1995). Kepala sekolah keempat, Bapak Syukur Stefanus ( 1995-2004). Kepala Sekolah kelima, Bapak Drs. Paulus Hansko( 2005-2008). Kepala Sekolah keenam, Bapak Donatus Jahan, S.Pd ( 2009-2016), dan Kepala Sekolah ketujuh, Bapak Fransiskus Ndejeng, M.Pd.( 2017-2023).
Semoga, dari tahun ke tahun, SMP Negeri 1 Komodo, semakin bergeliat dalam pengembangan SDM bermutu untuk kepentingan daerah, nasional yang kita cita-citakan untuk mencapai masyarakat yang adil , cerdas dalam bidang teknologi, literasi, numerasi, dan sains, dan digitalisasi, serta berkarakter sesuai visi misi sekolah di atas. Hasil asesmen Nasional tahun 2021, sebagai alat ukur untuk pemetaan mutu sekolah sesuai Rapor Mutu yang dinyatakan dalam angka-angka kualitatif dan kuantitatif, SMP Negeri 1 Komodo, tentu, akan terus berusaha lebih baik lagi dari tahun kemarin. Semoga!